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就是心房和心室都完全分为左右两个，肺动脉与大动脉完全分开；肺动脉与右心室相连，大动脉与左心室相连，两种血液不再混合，即肺循环与体循环完全独立。所以，大动脉中全是含氧量高的血，各种组织能得到更多的氧，代谢活动的水平提高。
所有鸟类和哺乳动物都是，它们大多数是恒温动物，这也与血液循环系统更为完善有关。还有高等爬行动物中的鳄鱼，它的心脏纵隔是完整的，也出现了四个腔的心脏和完全独立的大、小循环。
两类最基本的也是最简单的区别就是呼吸方式，两栖类大多都是变态发育，小时用鳃呼吸，长大后用体表兼肺呼吸，而爬行类用肺呼吸。所以扬子鳄属于两栖类。
两种分类的概念（定义）。
两栖类即两栖纲，爬行类即爬行纲。
两栖纲Amphibia是一类原始的、初登陆的、具五趾型的变温四足动物，皮肤裸露，分泌腺众多，混合型血液循环。其个体发育周期有一个变态过程，即以鳃（新生器官）呼吸生活于水中的幼体，在短期内完成变态，成为以肺呼吸能营陆地生活的成体。现生的有3目约40科400属4000种。除南极洲和海洋性岛屿外,遍布全球。我国现有11科40属270余种，主要分布于秦岭以南、华西和西南山区属种最多。两栖动物既有从鱼类继承下来适于水生的性状，如卵和幼体的形态及产卵方式等；又有新生的适应于陆栖的性状，如感觉器、运动装置及呼吸循环系统等。变态既是一种新生适应，又反映了由水到陆主要器官系统的改变过程。
爬行纲Reptilia头骨全部骨化 ，外有膜成骨掩覆，以一个枕髁与脊柱相关联，颈部明显，第一、二枚颈椎特化为寰椎与枢椎，头部能灵活转动，胸椎连有胸肋，与胸骨围成胸廓以保护内脏。这是动物界首次出现的胸廓。腰椎与两枚以上的荐椎相关联，外接后肢 。除蛇类外 ，一般有两对5出的掌型肢（少数的前肢4出） ，水生种类掌形如桨 ，指、趾间连蹼以利于游泳，足部关节不在胫跗间而在两列跗骨间，成为跗间关节 。四肢从体侧横出 ，不便直立 ；体腹常着地面，行动是典型的爬行；只少数体型轻捷的能疾速行进。大脑小脑比较发达 。心脏3室（ 鳄类心室虽不完全隔开 ，但已为4室）。肾脏由后肾演变，后端有典型的泄殖肛腔，雌雄异体，有交接器 ，体内受精 ，卵生或卵胎生 。具骨化的腭 ，使口、鼻分腔，内鼻孔移至口腔后端；咽与喉分别进入食道和气管，从而呼吸与饮食可以同时进行。
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